一般纳税人代理记账与小规模纳税人代理记账最大的区别在于应税销售额，也就是业务量的多少。经过筛选和调研代理记账很可能会成为带动经济发展的新生力量。
具体区别如下：
1、做账的单据不一样
做账的原因是业务的产生，做账依据就是业务发生后的单据。一般纳税人的应税销售额比较高，因此一般纳税人代理记账需要处理的单据不管是从数量上还是金额上都比小规模纳税人多。
另外，一般纳税人涉及到增值税的认证和抵扣，操作比较复杂，涉税事物也比小规模纳税人多。
2、报税次数不一样
小规模纳税人是按季报税的，而一般纳税人是按月申报。
3、记账标准不一样
一般纳税人每月都有银行对账单、工资明细表和各种入账单据等要设置明细核算，账务标准比小规模纳税人高。
4、记账审核难度不一样
一般纳税人的增值税有进项票抵扣项目，税务局对于公司去买假发票进行抵扣的行为审查非常严格。因此，一般纳税人的审查会比小规模纳税人的税务审查更加严格，审查流程也较为复杂。
一般纳税人代理记账流程
1、签订合同。接受委托签订财务外包代理记账合同，确定服务项目及费用。
2、接票。届时客户将当月做账票据送到代理记账公司，或代理记账公司将安排外勤会计到客户指定地点收取当月做账票据，并对票据进行初步整理。对于新设立的从来没有做过财务会计工作的客户，代理记账公司将帮助他们：开立会计帐户，建立会计核算体系;根据客户提供的合法原始凭证(指：购销发票、入库单、领料单、款项汇出汇入底单及其他财务收支单据、有关经济合同等)编制会计分录;记账及结账;编制会计报表。
3、做账。记帐会计对客户票据进一步整理，对票据存在的问题与客户及时沟通，进行会计核算、帐务处理，税款计算。
审核会计对记账会计做账结果进行审核，包括票据完整性、合法性的审核、账务处理正确性的审核、税款计算合法性的审核、往来账的核对、并对客户账务问题的隐患给予准确评估。在所有账务审核无误后填制税务纳税申报表，税收缴款书，并对纳税情况与客户沟通。为客户代理记帐,并办理税务登记，减免税手续，一般税人申请手续、发票审批手续等。
4、报税。外勤会计将审核会计填制的税收缴款书交到客户开户银行，划转税款。外勤会计到国、地税税务所上门申报。专人负责网上税务申报、个人所得税重点纳税人申报。
5、回访。由代理公司返回税单、财务报表、纳税申报表，与出纳对账，安排下月工作。及时反馈给客户税务最新的各项政策、通知。一般纳税人是指年应征增值税销售额(以下简称年应税销售额，包括一个公历年度内的全部应税销售额)超过财政部规定的小规模纳税人标准的企业和企业性单位。一般纳税人的特点是增值税进项税额可以抵扣销项税额。